Webmin
Для удобства управления сервером рекомендую установить на него панель управления Webmin. Webmin позволяет выполнять с сервером все действия (кроме интерактивных команд) через веб-интерфейс. Даже мне, при том, что командная строка не вызывает у меня абсолютно никаких затруднений, многие операции удобнее выполнять через Webmin, а человеку, только начавшему общаться с линуксом, Webmin жизненно необходим.
Webmin — бесплатная программа, загружается с официального сайта http://www.webmin.com/download.html, имеются готовые бинарные пакеты для Debian, Ubuntu, Fedora, CentOS, SuSE, Mandrake Linux, Solaris, Windows и исходники для установки на любой системе, имеющей Perl.
Логиниться в Webmin можно от имени root или любого другого пользователя, имеющего sudo на все команды. Сразу после установки панель доступна по протоколу http на порту 10000. Рекомендую сразу же переключить её на протокол https и произвольный порт, это существенно повысит безопасность. Настройки порта, доступа по защищённому протоколу, языка (русский есть) и т.д. можно выполнить на странице настроек:

Страница настроек Webmin
Раздел «Службы» предоставляет управление системными службами. Большая часть служб Вашего сервера уже настроена и их настройки Вам изменять не потребуется.
Чаще всего необходимо изменять настройки сервера MySQL и веб-сервера Apache.
На основной странице настроек сервера MySQL Вы можете выбрать категории настроек сервера, с которыми будете работать или отдельную базу данных, над которой будете производить операции.

Страница управления базами данных Webmin
Первое, что Вам потребуется — создать новую базу данных. Для этого перейдите по ссылке «Создание новой базы данных»
Откроется страница создания базы данных. Для создания базы данных достаточно указать её имя, остальные поля можно оставить по умолчанию и нажать кнопку «Создать». После возврата на основную странцу Вы увидите в списке новую базу данных.

Страница создания базы данных
Для редактирования базы данных Вам надо нажать на ссылку на нужную базу в списке. Откроется страница редактирования баз данных, на которой Вы увидите все имеющиеся в базе таблицы.
Самые полезные функции находятся внизу страницы. Кнопка «Резервирование базы данных» позволяет настроить резервное копирование, а кнопка «Исполнить SQL» позволяет выполнить запрос к базе данных.

Страница редактирования базы данных
Для того, чтобы загрузить имеющийся дамп базы, Вам надо нажать кнопку «Исполнение SQL» и перейти во вкладку «Run SQL from file». Файл дампа базы является последовательностью команд SQL, которые надо выполнить, чтобы получилась копия исходной базы данных. На этой странице под локальным файлом понимается файл, уже загруженный на сервер, а под загружаемым — файл, который будет автоматических загружен с Вашего компьютера.
Возможно, Вам потребуется создание пользователей SQL. Для этого Вам надо с основной страницы управления SQL перейти в раздел «Права пользователя и там выбрать ссылку «Создание пользователя». На открывшейся странице Вам надо указать имя пользователя, установить пароль и установить права пользователя. Если у Вас нет реальной необходимости дать этому пользователю доступ из интернета (для работы CMS такой необходимости нет), укажите в поле «Узлы» localhost: это повысит безопасность. Пароль и права Вы в дальнейшем можете изменять.

Создание пользователя MySQL
Другой важный раздел настроек служб — настройка веб-сервера Apache. На странице настройки веб-сервера есть три вкладки: глобальные настройки, список существующих виртуальных хостов и создание нового виртуального хоста.
Веб-сервер уже настроен, скорее всего, вносить изменения в его глобальную конфигурацию Вам не потребуется.
После внесения изменений на любой из страниц управления веб-сервером Вам необходимо нажать на ссылку «Применить изменения» для рестарта веб-сервера. Изменения начинают действовать только после рестарта веб-сервера.
На странице существующих виртуальных хостов Вы можете увидеть список всех виртуальных хостов, имеющихся на Вашем сервере, отредактировать или удалить виртуальный хост.
На странице создания виртуального хоста Вы можете добавить новый виртуальный хост.
Выбор адреса и порта. В этих разделах Вы выбираете адрес и порт, на котором будет отвечать сайт. Значение по умолчанию — любой адрес и любой порт, эти значения можно оставить, если нет необходимости разместить сайт на нестандартном порту или на выделенном ip-адресе.
Корневой каталог документов. В этом каталоге будет размещён сайт. Для размещения виртуальных хостов на Вашем сервер подготовлена директория /sites, в которой предполагается создание директорий, совпадающих по имени с доменом, но Вы можете свободно выбрать или создать любую директорию, на работоспособности это никак не скажется.
Название сервера. Доменное имя, на которое будет откликаться виртуальный хост.
Добавить виртуальный сервер в файл. По умолчанию предлагается добавление в основной файл конфигурации, но это неудобно при большом количестве виртуальных хостов. Значительно удобнее размещать каждый виртуальный хост в отдельном файле имя_домена.conf, расположенном в директории /etc/httpd/conf/vhosts/.
Копировать директивы из. Вы можете выбрать другой виртуальный хост, настройки которого будут скопированы в настройки нового хоста.

Общие настройки Apache

Создание нового виртуального хоста
Страница «Пользователи и группы» раздела «Система» предоставляет средства для добавления, изменения и удаления пользователей и групп на сервере.
На странице паролей Вы можете поменять пароль любому пользователю.
Страница «Запущенные процессы» позволяет увидеть все процессы, работающие на данный момент на сервере. Кликнув по PID процесса, Вы попадаете на страницу редактирования процесса, на которой можете изменить приоритет процесс, снять процесс, приостановить и возобновить процесс, получить информацию об открытых процессом файлах и сокетах.

Страница процессов
На странце «Расписание заданий cron» Вы можете настроить исполнение задач по расписанию. Для создания нового задания необходимо указать имя пользователя, от которого оно будет выполняться (по умолчанию — root или тот пользователь, под которым залогинились в Webmin), команду, которую надо выполнить (обратите внимание, что cron требует указания полного пути к исполняемому файлу) и время запуска программ. Для того, чтобы отметить несколько минут, часов, дней, месяцев надо использосать Ctrl-клик мыши.

Страница создания задания cron
Страница «Резервное копирование файловых систем» позволяет настроить резервное копирование файлов. По умолчанию резервное копирование на Вашем сервере не настроено. Вначале Вам надо выбрать каталог, который будете копировать, после этого нажмите кнопку «Добавить для резервного копирования». В открывшемся окне Вы сможете настроить куда копировать, дополнительные опции и расписание для автоматического копирования.
На странице «Log File Rotation» Вы можете настроить ротацию (архивирование и удаление) логов. По умолчанию ротация настроена, если надо, Вы моежете изменить параметры ротации и добавить логи, которых нет по умолчанию.
На странице менеджера ПО Вы можете проверить установлен ли интересующий Вас пакет, установить новый пакет из разных источников с помощью команд rpm и yum. Разница между командами rpm и yum в том, что rpm позволяет устанавливать пакет из любого источника, но не разрешает зависимости пакета, а yum автоматически разрешает зависимости пакета, но может устанавливать пакеты только из заранее определённых репозиториев. Также на этой странице Вы можете определить, какому пакету ПО принадлежит интересующий Вас файл.
Очень важная страница — командная оболочка в разделе «Остальное». В командную строку можно ввести любую команду и её вывод будет отображён на этой же странице. Единственное ограничение — через эту страницу невозможно вызывать интерактивные команды, требующие интерактивного ввода или отображающие информацию в реальном времени, такие, как ntsysv, top, mtr, tail -f и им подобные.

Страница командной оболочки
С остальными страницами Вы сможете разобраться без труда по мере необходимости. Или задавайте вопросы — буду дополнять новые статьи.